Su padre asumió como tesorero de la entidad granate en 1971, su hijo es vicepresidente primero de la actual conducción que encabeza Nicolás Russo. A Chebel le tocó presidir a Lanús en dos ciclos consecutivos, entre 1994 y 2000, un tiempo de reconstrucción y crecimiento, tanto en lo deportivo como en lo institucional.
Ya instalado definitivamente en primera división, en la primera presidencia de Emilio Chebel Lanús ganó la Copa Conmebol 1996 y dos subcampeonatos locales, en tanto que se realizaron muchas obras, principalmente en la remodelación del estadio. En aquellos años, cuando se intentó avanzar hacia la privatización del fútbol en la Argentina, Chebel fue un notorio defensor de que las entidades permanecieran en manos de los socios.
Luego de su segunda presidencia no volvió a ocupar cargos electivos, aunque siempre se mantuvo como cercano colaborador de cada conducción que lo sucedió hasta ayer, cuando dejó de existir.
A Chebel lo velan en Casa Lombardo en H. Yrigoyen 4834.